La Pinacothèque a une mission unique: conserver et exposer les œuvres d'artistes qui ont vécu et travaillé à Bologne et en Émilie-Romagne, en particulier du XIIIe au début du XIXe siècle.
Certaines œuvres ont leur propre histoire, beaucoup ont été sauvées d'églises fermées ou tournées à d'autres fins, et d'autres ont été restituées à Bologne après que Napoléon Ier les eut emportées au Louvre à Paris.
Les collections du musée comprennent des œuvres de Raphaël, Pérugin, Tintoret et d'autres artistes de la Renaissance
